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 Mon stage... La génétique du Jacaranda copaia.

31/7/2008

Certains voulaient savoir quel genre de boulot je fait pendant mon stage... Je bosse pour l'INRA, au sein d'une équipe travaillant en génétique.

Le but est de savoir comment se comporte la diversité génétique des populations de copaïa (Jacaranda copaia) en fonction des traitement d'exploitation forestière.
Pour cela on observe la variabilité allélique de chaque population sur des zones de l'ADN que l'on appelle les microsatellites. Les microsatellites sont des répétitions de 2 à 7 nucléotides, on peut donc trouver des allèles de tailles différentes dans la population. L'avantage des microsatellites est leur caractère neutre, c'est-à-dire que leur variation n'a pas d'effet sur le développement et l'aspect de l'organisme.
Mon travail est donc de mesurer les différentes tailles d'allèles pour chaque individus étudiés de diverses populations. Je fais cela, au laboratoire, en amplifiant l'ADN (par méthode PCR, afin d'augmenter la quantité de matière génétique) et en utilisant des amorces, découpant l'ADN spécifiquement aux extémités des microsatellites en question, j'utilise 5 amorces différentes (donc 5 microsatellites sont ici étudiés). L'ADN traité aux amorces est ensuite passé dans une machine que l'on appelle un séquenceur, il sert à mesurer la taille des fragments de microsatellites présents dans la solution.
Je récupère les données grâce à un logiciel (GeneMapper) et je les traite.
Voilà pour le moment c'est ce que j'ai fait, mais il y a des soucis, certaines amorces n'ont pas fonctionnées... J'espère que ce que j'ai décrit n'est pas trop compliqué.

Le travail de labo est fait à l'étage de l'aile droite du batiment INRA (ci-dessus, un peu caché par l'arbre), le séquenceur est au rez-de-chaussée de l'aile droite et je fais le traitement des données dans la partie avant du bâtiment.

Catégorie : Non spécifié

JL Stanus, le 29-07-2009 à 09:23:52 :

:D

Très intéressant ta deion! Au contraire! Au final ton stage s'est il bien déroulé? Est-il à continuer? Est ce que tu pourrais me donner une adresse de contact pour ce laboratoire? Je te remercie.

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